Présentation
La plateforme Proteom'IC propose des analyses protéomiques par spectrométrie de masse depuis l'extraction des protéines jusqu'aux analyses statistiques des données obtenues ainsi que des analyses fonctionnelles multi-omics.
4 systèmes nanoLC-MSMS (2 timsTOF et 2 Orbitrap)
160 projets / an
7 membres experts
59 publications (2019-2023)
99,5% de clients satisfaits sur les 5 dernières années
Membres
Comité Scientifique
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Dr Pierre Sohier : Equipe Biologie Cutanée (Sélim Aractingi) et Médecin Anatomo-Pathologiste à l'Hôpital Cochin
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Dr Ismaël Boussaïd : Equipe Hématopoïèse Normale et Pathologique (Michaëla Fontenay & Didier Bouscary) et Pharmacien Biologiste à l'Hôpital Cochin
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Dr Frédérique Verdier : Equipe Biologie de la Transmission du Plasmodium (Catherine Lavazec)
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Dr Gwladys Bertin : Equipe Interactions Hote-Pathogène à l'Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Prestations
Proteom'IC dispose de matériels et d’expertises permettant de répondre à une large gamme de demandes en protéomique :
- Analyse protéomique quantitative globale : quantification relative ou en valeur absolue selon le modèle ou tissu étudié (dont secrétômes et vésicules)
- Analyse protéomique des partenaires protéiques de molécules appâts par Co-IP, AP-MS, BioID
- Recherche de modifications post-traductionnelles dans des protéomes totaux ou sur des protéines purifiées : phosphorylations, acétylations, N-glycosylations et autres modifications
- Analyses protéomiques de tissus fixés et inclus en paraffine (coupes FFPE)
- Analyses protéomiques d'expectorations et de larmes
- Identification et caractérisation de protéines purifiées en solution ou contenues dans des gels d’acrylamide
- Analyse statistique des données obtenues
- Analyse fonctionnelle de données de protéomique, transcriptomique et métabolomique
- Formation et mise à disposition de logiciels informatiques pour les analyses fonctionnelles
- Conseil et développement en microanalyse de protéines par nanoLC-MS/MS
Équipements
La plateforme est équipée de différents matériels destinés à la préparation des échantillons en vue de leur analyse par spectrométrie de masse par différents analyseurs et modes d'ionisation :
- 2 spectromètres de masse de type timsTOF (HT et Pro)
- 2 spectromètres de masse de type Orbitrap (Fusion et Qexactive plus).
Elle dispose d’une salle propre équipée d’une hotte à flux laminaire horizontal pour la préparation des échantillons et de moyens informatiques performants. Elle a de plus directement accès à d'autres matériels situés sur le site de l’Institut Cochin : systèmes de chromatographie AKTA FPLC et AKTA Micro, scanner de fluorescence Typhoon, ultracentrifugeuses, lyophilisateur.
Tarifs
Les tarifs indiqués concernent les équipes de recherche académiques de l'Université Paris Cité, de l'Inserm et du CNRS pour la colonne de gauche ainsi que les équipes de recherche académiques d’autres EPST ou EPIC pour la colonne de droite.
Les demandes relevant d'équipes de recherche privées feront l’objet un devis.
Tarifs 2024 des prestations
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Prestations |
Université Paris Cité * ou Inserm * ou CNRS * |
Autres EPST ou EPIC |
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Recherche de partenaires * |
150 € / échantillon |
200 € / échantillon |
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Analyse de protéomes totaux * (Label-Free) |
400 € / échantillon |
550 € / échantillon |
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Analyse de protéomes totaux avec quantification absolue * |
550 € / échantillon |
650 € / échantillon |
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Analyse protéomique d'échantillons FFPE * |
450 € / échantillon |
550 € / échantillon |
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Analyse protéomique de plasma (inclus le kit de déplétion) * |
600 € / échantillon |
650 € / échantillon |
| Analyse protéomique de larmes * | 160 € / échantillon | 200 € / échantillon |
| Analyse protéomique d'expectorations * | 630 € / échantillon | 790 € / échantillon |
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Analyse de Phosphoprotéome * |
250 € / échantillon |
300 € / échantillon |
| Analyse Phosphoprotéomique * + Protéomique totale * | 550 € / échantillon | 650 € / échantillon |
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Digestion "in-gel" |
60 € / échantillon |
100 € / échantillon |
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Analyse d'une protéine purifiée en solution |
110 € / échantillon |
140 € / échantillon |
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Analyse fonctionnelle synthétique |
230 € / projet |
320 € / projet |
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Formation sur logiciels d’analyse fonctionnelle |
40 € / heure |
60 € / heure |
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Mise à disposition des logiciels d'analyse fonctionnelle sur la plateforme |
540 € / an |
700 € / an |
* incluant la préparation et l'analyse statistique. NB : minimum de n=4 répliquas biologiques. Prix par échantillon et par répliqua. A partir de n=5, 10% de remise offerts.
* si vous souhaitez régler avec un bon de commande AUTRE QUE Université Paris Cité, Inserm ou CNRS, 15% de frais de gestion supplémentaires vous seront appliqués par l'ADR Inserm Paris Ile-de-France Centre Nord.
Qualité
Proteom'IC est certifiée ISO9001 et NFX50-900. Le renouvellement de ces certifications a eu lieu en octobre 2024 par l'organisme certificateur LRQA.
- Certificats d'approbation
nfx50-900.pdf - pdf 157.84 Ko iso9001.pdf - pdf 848.02 Ko - Cartographie
cartographie.pdf - pdf 54.79 Ko - Questionnaire de Satisfaction dédié Spectrométrie de Masse
- Questionnaire de Satisfaction dédié Analyses Fonctionnelles
- Fiche de Réclamation Client
Formations
Publications
Contacts
par email :
par téléphone :
01.40.51.64.99 : Emilie-Fleur Gautier / Guilhem Clary
01.40.51.64.98 : Marjorie Leduc / Virginie Salnot / Cédric Broussard
01.40.51.64.17 : Johanna Bruce / Maryam Aboutiman
01.40.51.64.36 : Morgane Le Gall / Anne Degavre
par courrier :
Institut Cochin - Bâtiment Méchain - 22 rue Méchain - 75014 Paris
localisation dans le bâtiment Méchain :
RDC : Spectrométrie de Masse
2ème étage, pièce 234 : Analyses Fonctionnelles
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