Comité Scientifique

  • Dr Pierre Sohier : Equipe Biologie Cutanée (Sélim Aractingi) et Médecin Anatomo-Pathologiste à l'Hôpital Cochin
  • Dr Ismaël Boussaïd : Equipe Hématopoïèse Normale et Pathologique (Michaëla Fontenay & Didier Bouscary) et Médecin Hématologiste à l'Hôpital Cochin
  • Dr Frédérique Verdier : Equipe Biologie de la Transmission du Plasmodium (Catherine Lavazec)
  • Dr Gwladys Bertin : Institut de Recherche pour le Développement (IRD)

Prestations

Proteom'IC dispose de matériels et d’expertises permettant de répondre à une large gamme de demandes en protéomique :

  • Analyses quantitatives comparatives globales de protéomes / sécrétômes (Quantification relative ou absolue, Label Free, SILAC, iTRAQ, TMT)
  • Identification et quantification comparative de partenaires protéiques (AP-MS / Co-IP / Bio-ID)
  • Analyses comparatives globales de phosphoprotéomes
  • Analyses comparatives globales d'acétylations, N-glycosylations ou autres modifications post-traductionnelle sur demande
  • Analyse de coupes FFPE (matériel biologique fixé et inclu en paraffine)
  • Identifications et charactérisation de protéines (à partir de fragments de gel ou en solution)
  • 1D / 2D western blots
  • Analyses fonctionnelles (Protéomique, transcriptomique, métabolomique, analyses intégratives, formations, mise à disposition d'un poste d'analyse)

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Tarifs

Les tarifs indiqués concernent exclusivement les équipes de recherche académiques de l'Université Paris Cité, de l'Inserm et du CNRS pour la colonne de gauche ainsi que les équipes de recherche académiques d’autres EPST ou EPIC pour la colonne de droite.

Les demandes relevant d'équipes de recherche privées feront l’objet un devis.

 

Prestations courantes

  UPC, Inserm, CNRS Autres EPST ou EPIC
Préparation des échantillons pour analyse MS (digestion des protéines + purification des peptides) 20 € / éch 20 € / éch
Préparation des échantillons FFPE 50 € / éch 60 € / éch
Analyse MS ou nanoLC-MS/MS (comptabilisé à l’heure) 90 € / h 90 € / h

Forfait analyse Label-Free en quadruplicats biologiques comptabilisé par échantillon (incluant la préparation et l’analyse statistique)

450 € /éch / réplicat 550 € / éch / réplicat
Forfait Phosphoprotéomique (incluant la préparation et l’analyse statistique) 300 € /éch / réplicat  350 € /éch / réplicat
Analyse fonctionnelle :  
       Analyse fonctionnelle synthétique 175 € / projet 200 € / projet
       Formation sur logiciels d’analyse fonctionnelle  40 € / h 50 € / h
       Génération de réseaux et de diagrammes à façon  40 € / h 50 € / h
       Mise à disposition des logiciels sur la plateforme  350 € / an 400 € / an
       Traitements des données d’IP (identifications de potentiels faux interactants + génération de                réseau appât-proies)                                         175 € / projet 200 € / projet
Biochimie :   
       Mini Gel 1D 25 € 30 €
       Mini Gel 2D 65 € 80 €
       Mini Gel 1D + Transfert sur membrane 35 € 45 €
       Mini Gel 2D + Transfert sur membrane 75 € 90 €
       1D-Western Blot (prix hors coût de l’anticorps fourni par le client) 55 € 65 €
       2D-Western Blot (prix hors coût de l’anticorps fourni par le client) 90 € 105 €

 

Prestations sur demande (et sur devis)

  • Digestion automatisée à la trypsine de protéines piégées en gel d’acrylamide (incluant un gradient de nanoLC-MS/MS de 15minutes)
  • Forfait iTRAQ (4 ou 8 plex) ou TMT (11 plex) (incluant le kit et l’analyse statistique)
  • Enrichissement de peptides modifiés
  • Autres enrichissements biochimiques à la demande et selon capacité de la plateforme
  • Mise au point analyse quantitative MRM
  • Chromatographie liquide préparative microdébit
Une salle de la plateforme Proteom'IC

Équipements

La plateforme est équipée de différents matériels destinés à la préparation des échantillons en vue de leur analyse par spectrométrie de masse par différents analyseurs et modes d'ionisation : 2 spectromètres de masse timsTOF Pro, 2 spectromètres de masse de type Orbitrap (Fusion et Qexactive plus) et 1 MALDI TOF/TOF. Elle dispose d’une salle propre équipée d’une hotte à flux laminaire horizontal pour la préparation des échantillons et de moyens informatiques performants. Elle a de plus directement accès à d'autres matériels situés sur le site de l’Institut Cochin : systèmes de chromatographie AKTA FPLC et AKTA Micro, scanner de fluorescence Typhoon, ultracentrifugeuses, lyophilisateur.

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Contacts

Adresse postale : Institut Cochin - 22 rue Méchain - Bâtiment Méchain - RDC - 75014 Paris
Téléphones : +33. 1.40.51.64.99 / 17 / 98

Demande de RDV / Conseils / Questions

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Emilie-Fleur Gautier

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François Guillonneau

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Financements