80 projets en cours

12 équipements

1 réseau national

105 publications associées

Prestations

GENOM’IC propose à tout type d’équipe (académique et privée) des prestations en génomique certifiées ISO9001. La plateforme assure la production de données, leur analyse statistique et accompagne les équipes jusqu’à la publication scientifique.

  • Contrôle Qualité des acides nucléiques
  • Analyse d'expression génétique par puces à ADN
  • Analyse d'expression genes par NGS ou RNA-seq
  • Analyse polymorphisme ADN par puces à ADN
  • Analyse polymorphisme ADN par NGS
  • Analyse de la régulation de l’expression des gènes ou ChIP-Seq
  • Analyses bio-informatiques proposées par la plateforme
  • Mise à disposition de matériels
  • Extraction des ARN
  • Analyse single cell

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NextSeq 500 - Illumina

Analyses RNA-Seq : découvrez RADISH !

Nouveauté concernant les analyses de données RNA-Seq !
Vous pouvez maintenant explorer et réaliser des figures de vos données analysées par GENOM'IC grâce à l'outil RADISH (a RNA-Seq Dashboard In SHiny).
N'hésitez pas à l'essayer et à nous contacter pour plus de renseignements.

Voici l'adresse du Github pour découvrir l'application et avoir les informations d'installation :

https://github.com/GENOM-IC-Cochin/Radish

L'application est utilisable en interne sur cette adresse : http://sequencage:3200; ou bien depuis l'extérieur sur cette adresse http://localhost/, après avoir installé Docker et mis en route l'image Radish.

Projet NGS

Vous pouvez compléter le formulaire en ligne pour déposer vos demandes de projet NGS : https://sondage.inserm.fr/index.php/594389/lang-fr

Le formulaire comporte plusieurs questions dont nous avons besoin pour vous proposer une prestation adaptée, merci de prendre le temps d'y répondre, le traitement de votre demande n'en sera que plus efficace !
Et vous pouvez bien sûr nous contacter par mail si vous avez des questions : ngs.u1016@inserm.fr

Équipements

La plateforme dispose d'équipements dernière génération :

  • Séquenceurs haut débit
  • Appareils PCR en temps réel
  • PCR digitale
  • Puces à ADN
  • Appareils de contrôle qualité des échantillons, etc.

Voir tous les équipements de la plateforme ...

Financements

Réseau

Contact

Franck Letourneur

27 rue du Faubourg Saint-Jacques, Bâtiment Roussy, 3ème étage, 75014 Paris

Contacter par mail

Les publications