Les équipements de la plateforme GENOM'IC

Séquenceurs haut débit

Un système NextSeq™ 2000, un système NextSeq™ 500 et un MiSeq™ d’Illumina

Les séquenceurs Illumina utilisent la chimie de séquençage par synthèse (SBS) pour identifier la séquence de clusters (fragments amplifiés) directement sur le support de séquençage (flow cell).

Débits séquenceurs
Appareil Longeurs de lecture (min - max) Débit (min - max) Nombre de lectures (reads, min - max en millions)
MiSeq 36 - 600bp 540Mb - 15Gb 12 - 50
NextSeq 500 75 - 300bp 16Gb - 120Gb 130 - 400
NextSeq 2000 50 - 600bp 10Gb - 360Gb 100 - 1200

Appareils de PCR en temps réel

Quatre LC480 de Roche (bloc 384 et HRM) disponibles en pièce 5021 du bâtiment Faculté, en pièce 723 du bâtiment Roussy et en pièce 311 du bâtiment Méchain.
Pour réserver, accédez au calendrier de réservation de l’Institut ou contactez-nous.

 

Appareils de contrôle qualité des échantillons

  • Deux Bioanalyzer 2100 d’Agilent pour le contrôle qualité des ARN et des ADN
  • Deux Qubit de ThermoFisher pour le dosage des acides nucléiques par fluorimétrie
  • Un Nanodrop 8000 pour le dosage des acides nucléiques

Appareils annexes

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  • Quatre thermocycleurs Eppendorf, deux thermocycleurs 2720, trois thermocycleurs 9700, deux thermocycleurs SimpliAmp™ de ThermoFisher
  • Un serveur de stockage NetApp 300 To.

PCR digitale

Le système QX100™Droplet Digital™PCR de Biorad est composé :

  • d’un appareil générateur de gouttelettes
  • d’un appareil lecteur de gouttelettes après PCR.