BIOINFORMAT'IC

Cette plateforme est conçue pour accompagner vos besoins d'analyse avancée en biologie : épigénomique, transcriptomique, protéomique, et pour vous fournir un soutien tout au long de vos projets, du design expérimental à l’interprétation des résultats.

Prestations

Les services incluent :

  • Analyses "post-Differential Expression" (DEG) en RNA-Seq : optimisation des pipelines d'analyse et interprétation des résultats sur des données transcriptomiques
  • Analyses Fonctionnelles, du transcriptome au protéome : analyses d'enrichissements à façon, réseaux d'interaction, formation aux logiciels d'enrichissement et conseils en stratégie analytique
  • Analyses complètes en Single-Cell RNA-Seq : de l'acquisition des données jusqu'à la visualisation des clusters et l'identification des biomarqueurs, avec des outils avancés comme Seurat, Scanpy, et Harmony
  • Analyses spatiales avec Visium : interprétation des données transcriptomiques spatiales et leur intégration avec des données cellulaires et histologiques pour une vision complète de l'expression génique au sein des tissus
  • Accompagnement en gestion de projet et design expérimental : conseils sur la conception expérimentale, la planification des expériences et la gestion de vos projets de données complexes.

Contact

Benjamin Saintpierre
22 rue Méchain
75014 Paris