Description de la prestation Single Cell
La plateforme GENOM'IC propose un accompagnement expert pour vos projets de transcriptomique unicellulaire, en s’appuyant sur les technologies de pointe développées par 10X Genomics.
Nous sommes à ce jour l'une des seules plateformes en Île-de-France à proposer un soutien personnalisé à chaque étape du workflow, depuis l’évaluation de la faisabilité jusqu’à la production de données exploitables.
Nous prenons en charge une large gamme de protocoles 10X, incluant:
🔹 3' scRNAseq (+/- protéines de surface)
🔹 5' scRNAseq (+/- VDJ ou +/- protéines de surface)
🔹 Multiome : expression + accessibilité chromatinienne (ATAC) (noyaux seulement)
🔹 Flex GEM-X (+/- protéines de surface) – nouvelles générations de kits pour échantillons fixés ou FFPE (humain et souris seulement)
🔹 Autres protocoles spécifiques sur demande
Avant tout dépôt de projet, une réunion préparatoire avec l'équipe est obligatoire.
Chaque projet single cell étant unique, nous vous aidons à définir les conditions optimales :
– Type d’échantillon et préparation en amont
– Protocole adapté aux objectifs scientifiques
– Nombre de cellules, profondeur de séquençage, analyses souhaitées
Nous restons disponibles à chaque étape du projet pour répondre à vos questions techniques et vous conseiller. Contactez-nous dès les premières étapes de votre projet pour en discuter.
| Application | Input de départ |
| 3', 5' ou Multiome | 20 à 30 000 cellules ou noyaux |
| Flex |
300 000 cellules minimum 500 000 noyaux minimum |