PROTEOM'IC dispose de matériels et d’expertises permettant de répondre à une large gamme de demandes en protéomique. Les prestations décrites ci-dessous sont celles où nous avons l’expertise, mais nous sommes aussi en capacité de répondre à des demandes non répertoriées ci-dessous, une fois que nous les aurons examinées. Toutefois, les analyses de lipidomique, de métabolomique ou d’imagerie par spectrométrie de masse ne rentrent pas dans les champs de compétence de la plateforme.

Nous vous invitons à contacter la plateforme le plus tôt possible lors de la mise en place de votre programme d’analyse protéomique pour définir avec les ingénieurs de la plateforme les meilleures stratégies susceptibles de conduire à un résultat optimal. Vous trouverez ci-dessous les principales étapes du déroulement d’un projet avec la plateforme PROTEOM'IC.

Les prestations ci-dessous sont ouvertes à toutes les équipes de recherche publique, qu’elles fassent partie ou non de l’Université Paris Cité, ainsi qu’aux entreprises privées.

• Analyse protéomique quantitative globale : quantification relative ou en valeur absolue selon le modèle ou tissu étudié (dont sécrétômes et vésicules
• Analyse protéomique des partenaires protéiques de molécules apppâts par Co-IP, AP-MS, BioID
• Recherche de modifications post-traductionnelles dans des protéomes totaux ou sur des protéines purifiées : phosphorylations, acétylations, N-glycosylations et autres modifications
• Analyse protéomique de tissus fixés et inclus en paraffine (coupes FFPE)
• Analyse protéomique d'expectorations et de larmes
• Identification et caractérisation de protéines purifiées en solution ou contenues dans des gels d'acrylamide
• Analyse statistique des données obtenues
• Analyse fonctionnelle de données de protéomique, transcriptomique et métabolomique
• Formation et mise à disposition de logiciels informatiques pour les analyses fonctionnelles
• Conseil et développement en microanalyse de protéine par nanoLC-MS/MS