Membres de la plateforme
Prestations
La plateforme Proteom'IC dispose de matériels et d’expertises permettant de répondre à une large gamme de demandes en protéomique :
- Protéomique quantitative différentielle
- Recherche de partenaires protéiques
- Analyses de sécrétomes
- Recherche de modifications post-traductionnelles
- Phosphoprotéomique
- SDS-PAGE et électrophorèse bidimensionnelle
- Identifications de protéines à partir de fragments de gel par digestion « in-gel »
- 1D / 2D western blots
- MS simple d’une protéine purifiée
- Identification des protéines avec le logiciel « Mascot »
- Aide à l’interprétation des données quantitatives
- Comparaisons de listes de protéines identifiées avec le logiciel MyProMS
Équipements
La plateforme est équipée de différents matériels destinés à la préparation des échantillons en vue de leur analyse par spectrométrie de masse par différents analyseurs et modes d'ionisation : 2 spectromètres de masse timsTOF Pro, 2 spectromètres de masse de type Orbitrap (Fusion et Qexactive plus) et 1 MALDI TOF/TOF. Elle dispose d’une salle propre équipée d’une hotte à flux laminaire horizontal pour la préparation des échantillons et de moyens informatiques performants. Elle a de plus directement accès à d'autres matériels situés sur le site de l’Institut Cochin : systèmes de chromatographie AKTA FPLC et AKTA Micro, scanner de fluorescence Typhoon, ultracentrifugeuses, lyophilisateur, etc.
Tarifs
Les tarifs indiqués concernent exclusivement les équipes de recherche académiques de Université Paris Cité, de l'Inserm et du CNRS pour la colonne de milieu du tableau ainsi que les équipes de recherche académiques d’autres EPST ou EPIC pour la colonne de droite du tableau.
Les demandes relevant du domaine privé / industriel feront l’objet un devis.
Prestations courantes
| Prestation | Inserm, CNRS, UPC | Autres EPST ou EPIC |
|---|---|---|
| Préparation des échantillons pour analyse MS (digestion des protéines + purification des peptides) | 20 € / éch | 20 € / éch |
| Préparation des échantillons FFPE | 50 € / éch | 60 € / éch |
| Analyse MS ou nanoLC-MS/MS (comptabilisé à l’heure) | 90 € / h | 90 € / h |
| Forfait analyse Label-Free en quadruplicats biologiques, comptabilisé par échantillon (incluant la préparation et l’analyse statistique) | 450 € /éch / réplicat | 550 € / éch / réplicat |
| Forfait Phosphoprotéomique (incluant la préparation et l’analyse statistique) | 300 € /éch / réplicat | 350 € /éch / réplicat |
| Analyse fonctionnelle : | ||
| Analyse fonctionnelle synthétique | 175 € / projet | 200 € / projet |
| Formation sur logiciels d’analyse fonctionnelle | 30 € / h | 35 € / h |
| Génération de réseaux et de diagrammes à façon | 30 € / h | 35 € / h |
| Mise à disposition des logiciels sur la plateforme | 350 € / an | 400 € / an |
| Traitements des données d’IP (identifications de potentiels faux interactants + génération de réseau appât-proies) | 175 € / projet | 200 € / projet |
| Biochimie : | ||
| Mini Gel 1D | 25 € | 30 € |
| Mini Gel 2D | 65 € | 80 € |
| Mini Gel 1D + Transfert sur membrane | 35 € | 45 € |
| Mini Gel 2D + Transfert sur membrane | 75 € | 90 € |
| 1D-Western Blot (prix hors coût de l’anticorps fourni par le client) | 55 € | 65 € |
| 2D-Western Blot (prix hors coût de l’anticorps fourni par le client) | 90 € | 105 € |
Prestations sur demande (et sur devis)
- Digestion automatisée à la trypsine de protéines piégées en gel d’acrylamide (incluant un gradient de nanoLC-MS/MS de 15minutes)
- Forfait iTRAQ (4 ou 8 plex) ou TMT (11 plex) (incluant le kit et l’analyse statistique)
- Séparation Off-Gel
- Enrichissement de peptides modifiés
- Autres enrichissements biochimiques à la demande et selon capacité de la plateforme
- Mise au point analyse quantitative MRM
- Chromatographie liquide préparative microdébit
- Grand Gel 2D pour MS/MS
- 2D-DIGE + MS/MS
Satisfaction / Réclamations
Les formations
Contacts
Adresse postale : Institut Cochin, 22 rue Méchain, bâtiment Méchain - RDC, 75014 Paris
Téléphone de contact : +33 1 40 51 64 99 / 17 / 98
Financements
