173 projets en 2023
12 équipements
1 réseau national
105 publications associées
Membres de la plateforme
Prestations GENOM'IC
GENOM’IC propose à tout type d’équipe (académique et privée) des prestations en génomique certifiées ISO9001. La plateforme assure la production de données, leur analyse statistique et accompagne les équipes jusqu’à la publication scientifique.
- Contrôle Qualité des acides nucléiques (ADN/ARN)
- Analyse d'expression de gènes par RNA-seq
- Analyse de la régulation de l’expression des gènes par ChIP-seq, CUT&Run, CUT&Tag ou ATAC-seq
- Analyses bioinformatiques proposées par la plateforme
- Analyse Single Cell
- Mise à disposition de matériels
Analyses RNA-Seq : un outil pour exploiter vos données
Vous pouvez explorer et réaliser des figures de vos données analysées par GENOM'IC grâce à l'outil RADISH (a RNA-Seq Dashboard In SHiny).
N'hésitez pas à l'essayer et à nous contacter pour plus de renseignements.
Voici l'adresse du Github pour découvrir l'application et avoir les informations d'installation :
https://github.com/GENOM-IC-Cochin/Radish
L'application est utilisable en interne sur cette adresse : http://sequencage:3200; ou bien depuis l'extérieur sur cette adresse http://localhost/, après avoir installé Docker et mis en route l'image Radish.
Projet NGS
Vous pouvez compléter le formulaire en ligne pour déposer vos demandes de projet NGS : https://sondage.inserm.fr/index.php/594389/lang-fr
Le formulaire comporte plusieurs questions dont nous avons besoin pour vous proposer une prestation adaptée, merci de prendre le temps d'y répondre, le traitement de votre demande n'en sera que plus efficace !
Et vous pouvez bien sûr nous contacter par mail si vous avez des questions : ngs.u1016@inserm.fr
Dépôt des échantillons
prgen_f_130_fiche_depot_echantillons_v4.2.doc - MSWORD - 160 KO
Équipements
La plateforme dispose d'équipements dernière génération :
- Séquenceurs haut débit
- Appareils PCR en temps réel
- PCR digitale
- Appareils de contrôle qualité des échantillons, etc.
Financements
Réseau
Contact
Franck Letourneur
27 rue du Faubourg Saint-Jacques
Bâtiment Roussy, 3ème étage
75014 Paris
