Prestations

La plateforme Proteom'IC dispose de matériels et d’expertises permettant de répondre à une large gamme de demandes en protéomique :

  • Protéomique quantitative différentielle
  • Recherche de partenaires protéiques
  • Analyses de sécrétomes
  • Recherche de modifications post-traductionnelles
  • Phosphoprotéomique
  • SDS-PAGE et électrophorèse bidimensionnelle
  • Identifications de protéines à partir de fragments de gel par digestion « in-gel »
  • 1D / 2D western blots
  • MS simple d’une protéine purifiée
  • Identification des protéines avec le logiciel « Mascot »
  • Aide à l’interprétation des données quantitatives
  • Comparaisons de listes de protéines identifiées avec le logiciel MyProMS

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Une salle de la plateforme Proteom'IC

Équipements

La plateforme est équipée de différents matériels destinés à la préparation des échantillons en vue de leur analyse par spectrométrie de masse par différents analyseurs et modes d'ionisation : 2 spectromètres de masse timsTOF Pro, 2 spectromètres de masse de type Orbitrap (Fusion et Qexactive plus) et 1 MALDI TOF/TOF. Elle dispose d’une salle propre équipée d’une hotte à flux laminaire horizontal pour la préparation des échantillons et de moyens informatiques performants. Elle a de plus directement accès à d'autres matériels situés sur le site de l’Institut Cochin : systèmes de chromatographie AKTA FPLC et AKTA Micro, scanner de fluorescence Typhoon, ultracentrifugeuses, lyophilisateur, etc.

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Tarifs

Les tarifs indiqués concernent exclusivement les équipes de recherche académiques de Université Paris Cité, de l'Inserm et du CNRS pour la colonne de milieu du tableau ainsi que les équipes de recherche académiques d’autres EPST ou EPIC pour la colonne de droite du tableau.

Les demandes relevant du domaine privé / industriel feront l’objet un devis.

Prestations courantes

Prestation Inserm, CNRS, UPC Autres EPST ou EPIC
Préparation des échantillons pour analyse MS (digestion des protéines + purification des peptides) 20 € / éch 20 € / éch
Préparation des échantillons FFPE 50 € / éch 60 € / éch
Analyse MS ou nanoLC-MS/MS (comptabilisé à l’heure) 90 € / h 90 € / h
Forfait analyse Label-Free en quadruplicats biologiques, comptabilisé par échantillon (incluant la préparation et l’analyse statistique) 450 € /éch / réplicat 550 € / éch / réplicat
Forfait Phosphoprotéomique (incluant la préparation et l’analyse statistique) 300 € /éch / réplicat  350 € /éch / réplicat
Analyse fonctionnelle :  
       Analyse fonctionnelle synthétique 175 € / projet 200 € / projet
       Formation sur logiciels d’analyse fonctionnelle  30 € / h 35 € / h
       Génération de réseaux et de diagrammes à façon  30 € / h 35 € / h
       Mise à disposition des logiciels sur la plateforme  350 € / an 400 € / an
       Traitements des données d’IP (identifications de potentiels faux interactants + génération de                réseau appât-proies)                                         175 € / projet 200 € / projet
Biochimie :   
       Mini Gel 1D 25 € 30 €
       Mini Gel 2D 65 € 80 €
       Mini Gel 1D + Transfert sur membrane 35 € 45 €
       Mini Gel 2D + Transfert sur membrane 75 € 90 €
       1D-Western Blot (prix hors coût de l’anticorps fourni par le client) 55 € 65 €
       2D-Western Blot (prix hors coût de l’anticorps fourni par le client) 90 € 105 €

 

Prestations sur demande (et sur devis)

  • Digestion automatisée à la trypsine de protéines piégées en gel d’acrylamide (incluant un gradient de nanoLC-MS/MS de 15minutes)
  • Forfait iTRAQ (4 ou 8 plex) ou TMT (11 plex) (incluant le kit et l’analyse statistique)
  • Séparation Off-Gel
  • Enrichissement de peptides modifiés
  • Autres enrichissements biochimiques à la demande et selon capacité de la plateforme
  • Mise au point analyse quantitative MRM
  • Chromatographie liquide préparative microdébit
  • Grand Gel 2D pour MS/MS
  • 2D-DIGE + MS/MS

Contacts

Adresse postale : Institut Cochin, 22 rue Méchain, bâtiment Méchain - RDC, 75014 Paris
Téléphone de contact : +33 1 40 51 64 99 / 17 / 98

Emilie-Fleur Gautier

Contacter par mail

François Guillonneau

Contacter par mail

Financements