Qu’est-ce qui détermine le devenir d’une cellule et comment peut-elle changer de destin ?
Notre équipe s’intéresse aux mécanismes fondamentaux permettant aux cellules et aux tissus de se transformer lors du développement embryonnaire et de la maladie.
Nous étudions la régulation du génome, et plus particulièrement le rôle des enhancers, des séquences d’ADN qui contrôlent quand, où et à quel niveau les gènes sont exprimés. Ces éléments régulateurs sont essentiels pour établir l’identité cellulaire, et permettre aux cellules de faire preuve de plasticité, c’est-à-dire de changer d’état ou de fonction.
Nous étudions la transition épithélio-mésenchymateuse (TEM). Indispensable durant le développement embryonnaire, cette transition est détournée dans la progression métastatique des cancers. En comparant la TEM dans des contextes physiologiques et pathologiques, nous cherchons à comprendre ce qui distingue une plasticité "fonctionnelle" d’une plasticité "dérégulée".

Nous utilisons des approches interdisciplinaires, combinant :
- des modèles embryonnaires dérivés de cellules souches (pseudo-embryons),
- des technologies single-cell pour analyser la régulation du génome cellule par cellule,
- des technologies de séquençage à haut débit pour analyse de la chromatine (ATAC-seq, MNase-seq, ChIP-seq, RNA-seq),
- de l’imagerie dynamique par microscopie pour suivre les processus en temps réel,
- et des outils d’ingénierie du génome (type CRISPR/Cas9 ou /dCas9) pour tester directement la fonction des éléments régulateurs.

Nous visons à mieux comprendre les principes fondamentaux qui gouvernent l’identité cellulaire, et développer de nouveaux modèles expérimentaux pour étudier le lien entre développement et pathologie.
Notre équipe accueille des étudiant·es, ou postdoctorant·es curieux·ses, intéressé·es par la biologie du développement, la génomique, l’imagerie et les approches quantitatives, et désireux·ses de travailler à l’interface entre biologie fondamentale et recherche biomédicale.