Le microbiote intestinal joue un rôle essentiel dans la digestion et la protection contre les agents pathogènes, mais peut aussi devenir la cible de réponses immunitaires aberrantes qui contribuent aux maladies inflammatoires chroniques de l’intestin. Le groupe s’intéresse aux interactions entre les lymphocytes MAIT et le microbiote intestinal.

Les MAIT sont une population clef du fait de leur abondance chez l’humain (jusqu’à 10% des lymphocytes T de l’intestin, 40% des lymphocytes T du foie), leur conservation inter-espèces, leur capacité à répondre rapidement et fortement après stimulation, et leur modification dans de nombreuses pathologies, notamment celles associées à des dysbioses intestinales.

La caractéristique principale des lymphocytes MAIT, qui est conservée au cours de l’évolution des mammifères, est leur spécificité antigénique unique pour des métabolites dérivés de la voie de synthèse de la vitamine B2. Ces ligands instables sont produits par la plupart des bactéries et levures, mais pas par les cellules animales. 

Nous avons montré que les ligands reconnus par les MAIT circulent dans l’organisme et sont présentés dans le thymus, où ils contrôlent le développement des MAIT. Nous poursuivons l’exploration de cette interaction intrigante in vivo. Nous utilisons des modèles génétiques et gnotobiotiques (sans germe ou à microbiote contrôlé) couplés à des approches transcriptomiques et métagénomiques pour :

• Définir les règles de synthèse par le microbiote des ligands activant les MAIT. 
• Déterminer comment les ligands microbiens voyagent dans l’organisme et affectent les populations de MAIT.
• Déterminer si les MAIT jouent un rôle bénéfique ou délétère dans l’inflammation intestinale.
• Développer des outils pré-cliniques de manipulation des MAIT pour réduire l’inflammation intestinale.

Salou*, Legoux*, Gilet*, Darbois, du Halgouet, Alonso, Richer, Goubet, Daviaud, Menger, Procopio, Premel, Lantz. A common transcriptomic program acquired in the thymus defines tissue-residency of MAIT and NKT subsets. Journal of Experimental Medicine (IF 14.3) 2019 216:133-151. doi: 10.1084/jem.20181483. *Co-first authors.

Legoux*#, Gilet*, Procopio, Echasserieau, Bernardeau, Lantz#. Molecular mechanisms of lineage decisions in metabolite-specific T cells. Nature immunology (IF 25.6) 2019 20: 1244-1255. doi: 10.1038/s41590-019-0465-3. *Co-first authors. #Co-corresponding authors

Legoux#, Bellet, Daviaud, El Morr, Darbois, Niort, Procopio, Salou, Gilet, Ryffel, Balvay, Foussier, Sarkis, El Marjou, Schmidt, Rabot and Lantz#. Microbial metabolites control thymic development of Mucosal Associated Invariant T cells. Science (IF 47.7) 2019 366: 494-499. doi: 10.1126/science.aaw2719. #Co-corresponding authors. Comments in Science. 2019 Oct 25;366(6464):419-420; Nat Rev Immunol. 2019 Nov;19(11):662-663; Cardiovasc Res. 2020 Feb 1;116(2):e21-e22

Legoux*, Salou*, Lantz. MAIT cell development and function: the microbial connection. Immunity (IF 31.7) 2020 4:710. doi: 10.1016/j.immuni.2020.09.009. Review. *Co-first authors.

Zhang*, Legoux*, Vaughan, Moon. Opposing peripheral fates of tissue-restricted self-antigen-specific conventional and regulatory CD4+ T cells. European Journal of Immunology (IF 5.5) 2020. 50: 63-72. doi: 10.1002/eji.201948180. *Co-first authors.

Salou*, Legoux*, Lantz. MAIT cell development in mice and humans. Molecular Immunology (IF 4.4) 2021 130:31. doi: 10.1016/j.molimm.2020.12.003. Review. *Equal contribution.

Bugaut*, El Morr*, Mestdagh, Darbois, Paiva, Salou, Perrin, Fürstenheim, du Halgouet, Bilonda-Mutala, Le Gac, Arnaud, El Marjou, Guerin, Chaiyasitdhi, Piquet, Smadja, Cieslak, Ryffel, Maciulyte, Turner, Bernardeau, Montagutelli, Lantz# and Legoux#. A conserved transcriptional program for MAIT cells across mammalian evolution. Journal of Experimental Medicine (IF 14.3) 2024 221:2 doi: 10.1084/jem.20231487. *Co-first authors #Co-corresponding authors.

El Morr*, Fürhensteim*, Mestdagh, Franciskiewicz, Salou, Morvan, Dupré, Vorobev, Jneid, Premel, Darbois, Perrin, Mondot, Colombau, Bugaut, du Halgouet, Richon, Procopiot, Maurin, Phillippe, Rodriguez, Lantz# and Legoux#. MAIT cells monitor intestinal dysbiosis and contribute to host protection during colitis. Science Immunology (IF 16.3) 2024. 9:86 doi: 10.1126/sciimunol.adi8954 *Co-first authors. #Co-corresponding authors.

Germain, Veloso, Lantz and Legoux. Journal of Experimental Medicine (IF 14.3) 2025 222:1 doi: 10.1084/jem.20232298. Review.