L’objectif général de l’équipe est de mieux comprendre le dialogue et les interactions qui ont lieu entre les cellules immunitaires et les cellules endocrines pancréatiques, contribuant au développement, au fonctionnement et à l’homéostasie du pancréas ou, au contraire, aux manifestations pathologiques, en particulier le diabète de type 1 (DT1). Notre projet est composé de 3 axes de recherche majeurs : 1. Fonction des cellules endocrines pancréatiques et biomarqueurs (R. Scharfmann); 2. Mécanismes immunitaires et biomarqueurs de la progression du diabète de type 1 (R. Mallone/S. You); 3. Développement de nouveaux traitements immunomodulateurs et protecteurs des cellules bêta (R. Mallone/S. You/R. Scharfmann). 
En utilisant des technologies de pointe et à haut débit (immunopeptidomique, protéomique, RNAseq sur cellule unique, cytométrie de flux multiparamétrique, imagerie), des systèmes in vitro sophistiqués et des modèles in vivo développés par l'équipe, notre programme de recherche intègre la recherche fondamentale et translationnelle par des études chez la souris et l'homme, pour déchiffrer les mécanismes biologiques dans des contextes physiologiques et pathologiques, pouvant conduire à des opportunités thérapeutiques innovantes. L'identification de nouveaux biomarqueurs de cellules bêta/lymphocytes T et de cibles médicamenteuses pour le diagnostic, le pronostic ou le traitement du diabète de type 1 favorisera le transfert à la clinique, la valorisation, les partenariats et la reconnaissance internationale de nos expertises. Nos travaux à Paris sont en outre en synergie avec les activités de notre laboratoire satellite à Indianapolis (Indiana Bioscience Research Institute, US), qui offre un accès à une plate-forme iPS de pointe pour générer et manipuler génétiquement par CRISPR/Cas9 des cellules bêta dérivées d'iPS et à une expertise dans le développement de médicaments contre des cibles sélectionnées. Pour plus d’information, voir nos sites web : www.dearlab.orgwww.humanbetacelllines.com.

Principales publications et brevets

PUBLICATIONS

A. Carré, F. Samassa, Z. Zhou, J. Perez-Hernandez, C. Lekka, A. Manganaro, M. Oshima, H. Liao, R. Parker, A. Nicastri, B. Brandao, M.L. Colli, D.L. Eizirik, J. Aluri, D. Patel, M. Göransson, O. Burgos Morales, A. Anderson, L. Landry, F. Kobaisi, R. Scharfmann, L. Marselli, P. Marchetti, S. You, M. Nakayama, S.R. Hadrup, S.C. Kent, S.J. Richardson, N. Ternette, R. Mallone. Interferon-α promotes HLA-B-restricted presentation of conventional and alternative antigens in human pancreatic β-cells. Nat Commun. 2025. 16, 765. doi.org/10.1038/s41467-025-55908-9.

Villalba A, Gitton Y, Aiello V, Toupin M, Mazaud-Guittot S, Chédotal A, Scharfmann R. Imaging human pancreatic endocrinogenesis during early prenatal life. Diabetes. 2024, Nov 27:db240641. doi: 10.2337/db24-0641. 

Vecchio F, Carré A, Korenkov D, Zhou Z, Apaolaza P, Tuomela S, Burgos-Morales O, Snowhite I, Perez-Hernandez J, Brandao B, Afonso G, Halliez C, Kaddis J, Kent SC, Nakayama M, Richardson SJ, Vinh J, Verdier Y, Laiho J, Scharfmann R, Solimena M, Marinicova Z, Bismuth E, Lucidarme N, Sanchez J, Bustamante C, Gomez P, Buus S, the nPOD-Virus Working Group, You S, Pugliese A, Hyoty H, Rodriguez-Calvo T, Flodstrom-Tullberg M, Mallone R. Coxsackievirus infection induces direct pancreatic β-cell killing but poor anti-viral CD8+ T-cell responses. Sci Adv. 2024, 10(10): eadl1122. Doi: 10.1126/sciadv.adl1122.

Carré A, Vecchio F, Flodstrom-Tullberg M, You S, Mallone R. Coxsackievirus and type 1 diabetes: diabetogenic mechanisms and implications for prevention. Endocr Reviews. 2023, 44(4): 737-751. doi.org/10.1210/endrev/bnad007

Rachdi L, Zhou Z, Berthault C, Lourenço C, Fouque A, Domet T, Armanet M, You S, Peakman M, Mallone R, Scharfmann R. Tryptophan metabolism promotes immune evasion in human pancreatic β cells. EBioMedicine. 2023, Sep;95:104740. doi: 10.1016/j.ebiom.2023.104740.

Corcos N, Culina S, Deligne C, Lavaud C, You S* and Mallone R*. Oral Fc-coupled preproinsulin achieves systemic and thymic delivery through the neonatal Fc receptor and partially delays autoimmune diabetes. Front Immunol. 2021, 12:616215. doi: 10.3389/fimmu.2021.616215.

Gonzalez-Duque S, Azoury ME, Colli ML, Afonso G, Turatsinze JV, Nigi L, Lalanne AI, Sebastiani G, Carré A, Pinto S, Culina S, Corcos N, Bugliani M, Marchetti P, Armanet M, Diedisheim M, Kyewski B, Steinmetz LM, Buus S, You S, Dubois-Laforgue D, Larger E, Beressi JP, Bruno G, Dotta F, Scharfmann R, Eizirik DL, Verdier Y, Vinh J, Mallone R. Conventional and neo-antigenic peptides presented by β cells are targeted by circulating naïve CD8+ T cells in type 1 diabetic and healthy donors. Cell Metab. 2018, 28(6):946-960.e6

Oshima M, Knoch KP, Diedisheim M, Petzold A, Cattan P, Bugliani M, Marchetti P, Choudhary P, Huang GC, Bornstein SR, Solimena M, Albagli-Curiel O, Scharfmann R. Virus-like infection induces human β cell dedifferentiation. JCI Insight. 2018, 3(3):e97732. doi: 10.1172/jci.insight.97732.

 

BREVETS

2022- EB19114 - patent under consideration on “biomarkers of autoimmune T cells for the diagnosis and treatment of type 1 diabetes”, by Inserm-Transfert; inventors R. Mallone, S. You, F. Samassa, M. Giraud.

2019 - WO/2019/175380 “Antigenic peptides deriving from Secretogranin V and uses thereof for the diagnosis and treatment of type 1 diabetes” filed by Inserm-Transfert on March 16 2018 (EP18305286); inventors R. Mallone, J. Vinh, D. Eizirik, M. Colli, G. Afonso, S. Gonzalez-Duque, Y. Verdier.

2019 - WO/2019/175381 “Antigenic peptides deriving from PCSK2 and uses thereof for the diagnosis and treatment of type 1 diabetes” filed by Inserm-Transfert on March 16 2018 (EP18305287); inventors R. Mallone, J. Vinh, G. Afonso, S. Gonzalez-Duque, Y. Verdier, M.E. Azoury.

2019 - WO/2019/175384 “Antigenic peptides deriving from Urocortin 3 and uses thereof for the diagnosis and treatment of type 1 diabetes” filed by Inserm-Transfert on March 16 2018 (EP18305288); inventors R. Mallone, J. Vinh, G. Afonso, S. Gonzalez-Duque, Y. Verdier, M.E. Azoury.

The Scharfmann group filled many patents related to the generation of human beta cell lines (WO/2008/102000; WO/2003/033685; WO2013057164). They were the basis to create in 2005, a biotech company as a spin off from the lab. This company, EndoCells, is now named Human Cell Design (https://www.humancelldesign.com/) and is considered as a success story. RS is consultant for Human Cell Design. RS is also consultant for the french company ADOCIA (https://www.adocia.com/fr/) on their project related to islet encapsulation.