Une nouvelle plateforme à l'Institut Cochin : BIOINFORMAT'IC

BIOINFORMAT'IC, nouvelle plateforme de bioinformatique, est conçue pour accompagner les besoins d'analyse avancée en biologie - épigénomique, transcriptomique, protéomique - et pour fournir aux utilisateurs un soutien tout au long de leurs projets, du design expérimental à l’interprétation des résultats.

    Technologies
    Salle de bioinformatique

    Nos services incluent :

    • Analyses "post-Differential Expression" (DEG) en RNA-Seq : optimisation des pipelines d'analyse et interprétation des résultats sur des données transcriptomiques. 
    • Analyses complètes en "Single-Cell RNA-Seq" : de l'acquisition des données jusqu'à la visualisation des clusters et l'identification des biomarqueurs, avec des outils avancés comme Seurat, Scanpy, et Harmony.
    • Analyses spatiales avec Visium : interprétation des données transcriptomiques spatiales et leur intégration avec des données cellulaires et histologiques pour une vision complète de l'expression génique au sein des tissus.
    • Accompagnement en gestion de projet et design expérimental : conseils sur la conception expérimentale, la planification des expériences et la gestion de vos projets de données complexes.
    • Intégration de données publiques à vos projets : uniformisation des pipelines, intégration de données publiées avec vos propres données.

    BIOINFORMAT ‘IC est ouverte aux laboratoires extérieurs, pour les prestations d'analyse ne nécessitant pas la mise en place de nouveaux outils, et avec un rendez-vous préalable.

    Pourquoi choisir notre plateforme ?

    • Expertise pointue : une équipe de spécialistes des données haut débit.
    • Solutions sur-mesure : des services adaptés à vos besoins spécifiques, quel que soit le type d'analyse que vous souhaitez effectuer.
    • Support tout au long du projet : accompagnement à chaque étape, de la conception à l’interprétation des résultats.

    Contact

    Nous vous invitons à nous contacter pour toute demande de service, ou pour discuter de la manière dont nous pouvons soutenir vos projets en cours ou futurs.

    Benjamin SAINTPIERRE

    Contacter par mail