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IMAG'IC

En plein cœur de Paris la plate-forme d'imagerie cellulaire IMAG'IC de l'Institut Cochin, propose des services de microscopie photonique à haute résolution pour l'imagerie et l'analyse d'organisation moléculaire et structurelle des cellules, des tissus et des matériaux issus de la bio-ingénierie.

Plateformes technologiques

Responsable(s)

Pierre BOURDONCLE ITA statutaire Responsable plateforme

Certification(s)

15 systèmes d'acquisition

22 techniques d'imagerie

5 réseaux

268 articles dont 82 avec signature

260 formations/an

3 Masters et 2 Formations nationales

Membres

Pierre BOURDONCLE ITA statutaire Responsable plateforme
Thomas GUILBERT ITA statutaire Ingénieure de recherche
Gabriel LE GOFF ITA statutaire Assistant Ingénieur
Julie LESIEUR ITA statutaire Ingénieur d'étude
Bilal BOUKHORISSA ITA contractuel
Raphael BRAUD-MUSSI ITA contractuel Ingénieur d'étude
Assa DIABIRA ITA contractuel
Kévin RAGUETTE ITA contractuel Ingénieur d'étude

Conseil scientifique

Julie CHAUMEIL Chercheur statutaire Responsable d'équipe
Emmanuel DONNADIEU Chercheur statutaire Responsable d'équipe
Diana PASSARO Chercheur statutaire Responsable d'équipe

Équipements

  • 1 Imageur en Flux
  • 2 Microscopes de super-résolution
  • 2 Microscopes multi-photons
  • 4 Microscopes confocaux
  • 5 Microscopes plein champ
  • 2 Macroscopes
  • 1 Vibratome
  • 1 Imprimante 3D
  • Pompe

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DIVE
prestation coupe

Prestations

  • Clarification de tissu
  • Microscopie super-résolution Pointillisme SMLM : STORM, PALM, sptPALM, 3DSTORM
  • Microscopie super-résolution STED : STED-FLIM, 3D STED-FLIM, ExSTED
  • Microscopie d'Expansion ExM (cellulaire et tissulaire) : ProExM, TREx6, ExPath, ExSTED
  • Coupe épaisse de tissu ( ~ 400µm) frais, fixé
  • Imagerie intravitale
  • Confinement L2 (tissu d'origine humaine)
  • Confinement L3 (interaction hôte-pathogène, bactéries, parasites, virus)
  • Traitement  d'images (Segmentation, Deep learning, Histo-cytométrie, Tracking)
  • Cochin Image Database

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Applications

  • Imagerie moléculaire et cellulaire
    • super-résolution STORM PALM STED STED-FLIM  ExM
    • FRET FRET-FLIM FLIM Phasor
    • FRAP
    • migration cellulaire in-vitro, mouvement moléculaire
    • Biomarqueurs : Ca2+, pH, NaDH, Red/Ox, tension membranaire
  • Imagerie tissulaire
    • modèles murin, poisson, ovo, sphéroïde
    • migration cellulaire in-situ
    • Milieu perfusé, système d'anesthésie, Imagerie Intravitale
    • Contraste SHG et THG (collagène I et III, os, fibrogenèse, sarcomères)

Projets

Pierre BOURDONCLE

Cochin Image Database

Plateformes technologiques

Thomas GUILBERT

Métrologie des systèmes de microscopie photoniques

Plateformes technologiques

Julie LESIEUR

Microscopie d'Expansion ExM

Plateformes technologiques

Gabriel LE GOFF

Analyse d'images par deep-learning

Plateformes technologiques

Thomas GUILBERT

Microscopie intravitale

Plateformes technologiques

Julie LESIEUR

Clarification

Plateformes technologiques

Pierre BOURDONCLE
Thomas GUILBERT

QualiHealth : Amélioration de la Qualité des Données de Soins

Plateformes technologiques

Offres d'emploi

Actualités

Participation de OpenCID à la Journée Cycle de vie des données en biologie
Publié le
Actualité des plateformes
Interview de l’équipe d’IMAG’IC sur le site communautaire international de microscopie FocalPlane
Publié le
Technologies
Bienvenue sur les plateformes de l'Institut Cochin
Publié le
Technologies
Toutes nos actualités

Formations

Formation Cochin ImageJ 16 et 30 octobre 2024

Fin des inscriptions le 09/10/2023

Du 09/10/2024 au 30/10/2024

Formation Cochin QuPath 18 et 31 octobre 2024

Fin des inscriptions le 10/10/2024

Du 18/10/2024 au 31/10/2024

Formation CID Cochin Image Database

Fin des inscriptions le 20/12/2023

Du 20/12/2023 au 31/12/2024

Publications


ARL5b inhibits human rhinovirus 16 propagation and impairs macrophage-mediated bacterial clearance

2024 - PMID: 38332148
Suzanne FAURE-DUPUY et al.
EMBO Reports

Red-Emitting Pyrrolyl Squaraine Molecular Rotor Reports Variations of Plasma Membrane and Vesicular Viscosity in Fluorescence Lifetime Imaging

2024 - PMID: 39066698
Sonia Pfister et al.
Analytical Chemistry

The double-edged role of FASII regulator FabT in Streptococcus pyogenes infection

2024 - PMID: 39366941
Clara Lambert et al.
Nature Communications

Acute stress induces long-term metabolic, functional, and structural remodeling of the heart

2023 - PMID: 37380648
Thulaciga Yoganathan et al.
Nat Commun.

Financements

Réseaux

Contact

Pierre Bourdoncle

22 rue Méchain
75014 Paris

+33(0)1 40 51 65 84

Contacter par mail

Localisation

Bâtiment Roussy

Localisation

Localisation

Alumni
Martin
 Révillon Master2 EBI Analyse et segmentation efficace d'images pyramidales
Doctorat
Carla
 Polycarpe M1 microscopie de super résolution
Master UPCité
Dylan
 Rouvier stage ingénieur SupBiotech
Ingénieur
Simon
 Langlois Master2 STED-FLIM
Ingénieur microscopie MRI
Pierre
 Bandini stage ingénieur Microscopie d'Expansion
ingénieur
Halle Ruth
 Togbonou stage quantification 3D Python
UPEC
Marion
 Laurençon stage Microscopie d'Expansion
UNIVERSITÉ MCGILL, Montréal
Romain
Romain
 Naillon Master2 FLIM STED
Ingénieur Microscopie IJM ImagoSeine
Meryem
 Rezzik Master2 FLIM STED
Ingénieure Microscopie ICM QUANT
Linda
 Belgocine Master2 Analyse et acquisition systémique en imagerie cellulaire
ingénieur
Ryma
 Bebane Ingénieur en traitement du signal
-
Attaché de recherche clinique ARC/TEC
Clémence
 Conan Stage ingénieur Histo-Cytométrie
Ingénieur
Wilson
 Rippon Stage ingénieur Microscopie STORM STED multi-marquages
Responsable d'équipe R&D Stago
Valérie
 Drouet Technicienne Exceptionnelle
-
Technicienne Exceptionnelle
Béatrice
 Durel ingénieur microscopie
-
ingénieur microscopie
Achraf
 Oufqir Master2 Acquisitions et analyses systèmiques en imagerie cellulaire
ingénieur
Anatole
 Dannenmuller stage conception de cellules en impression 3D
3D Game Artist
Myriam
 Azarou Licence3 conception 3D pour la microscopie photonique
-
Chargée de missions QSE
Joisy
 Ngwese Licence3 L'imagerie in toto d'échantillon épais
-
ingénieur
Théo
 Campet stage ingénieur Synchronisation d'acquisition en microscopie multi-photonique intravitale avec la respiration du petit animal
Ingénieur Retency
Yasmine
 Khalil Master2 Erreurs de localisation en microscopie
ingénieur traitement d'images et développement
Oscar
 Regnault stage BTS synchronisation respiration est scanner multi-photon
technicien supérieur en système numérique
Meriem
 Ouriachi Licence3 STORM multi-couleur
-
ingénieur
Gabrielle
 Carron Master2 sptPALM
Graphiste & consultante marketing éthique
Mathieu
 Chebassier stage ingénieur restauration d'image par déconvolution 3D
Product Leader Services Configuration chez Renault Group
Sarah
 Barrin Master2 microscopie multi-photon, coupes, perfusion, anesthésie, clarification
Ingénieure en analyse d'images chez Centre Léon Bérard
Jennifer
 Coridon Master2 Photo-toxicité en photo-activation et PALM
-
Microscopy facility engineer
Louise
 Rimbault Master1 Imagerie en Flux
Technicienne chez LABEO franck duncombe
Sidy
 DIOP Master2 Photo-activation par laser pulsé sur microscope plein champ
ingénieur
Déborah
 Sitbon Licence3 contrat d'apprentissage microscopie SR PALM
-
Ingénieure d’Etude Clinico-Biologique Recherche Translationnelle Institut Curie
Mathilde
 Bruge stage L3 Mise en place et évaluation d'un OPO oscillateur paramétrique optique installé sur un microscope multi-photonique
-
Intégrateur optique chez Azur Light Systems
Mébarek
 Temagoult Master2 Comparaison des techniques de PALM/STORM avec le système Bioaxial
Ingénieur plateforme - Imagerie-Gif CNRS
Anaïs
 Bourges Licence3 contrat d'apprentissage PALM STORM deux couleurs
-
Postdoctoral Researcher KU Leuven
Kherroubi
 Mawloud Master2 Mise en place d'un serveur test d'images, permettant la stockage, l'archivage et la consultation en ligne
ingénieur
Camille
 Lebugle Ingénieur application laser
-
Lead developer Kosmos
Carine
 Breton Licence3 automatisation de la caractérisation de microscope photonique dans le cadre d'une démarche qualité
-
ingénieur
Mariano
 Gonzalez Pisfil Master2 Mise en place d'un protocole de microscopie à haute résolution PALM STORM
FLIM expert chez Ludwig-Maximilians Universität München
Jérôme
 Touvier Master2 Automatisation de restauration d'images par déconvolution 3D
ingénieur
Kompheak
 Eav Master2 Acquisition et analyse automatique d'images biologiques
ingénieur
Cécile
 Fort Licence3 Restauration d'images par déconvolution 3D
-
Postdoctoral Scientist
Isabelle
 Bouchaert Ingénieur Microscopie plein champ et confocale
-
_
Mériem
 Garfa-Traoré Ingénieur Microscopie plein champ et confocale
-
Ingénieur Microscopie plein champ et confocale
Aude
 Jobart-Malfait Ingénieur Microscopie plein champ et confocale
-
Ingénieur

Institut Cochin

22, rue Mechain

75014 PARIS

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